新撰組がタイムスリップ、いよいよ最終章！幕末…新撰組屯所にいたはずの隊士たちが、あるとき突然、闇の中で見知らぬ敵と対峙する状況に！副長・土方歳三と三浦啓之助ら一行は、圧倒的戦闘力を持つ戦国時代の蜂須賀小六、木下藤吉郎に捕らえられる。時はまさに、歴史の一大転機・桶狭間の戦いを迎えようとしていた…しかし、三浦の暴走が歴史の歯車を大きく動かすことになり、織田信長は死去。近藤勇も斃れ、歴史的状況は混沌の一途をたどることに。木下藤吉郎、明智光秀、松平元康たちが新撰組と新たな歴史を切り開く！